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2003年10月：中国科技论文在线网站（http://www.paper.edu.cn）正式上线运营，是中国首家开放获取网络平台。其创建的初衷是拓宽学术交流渠道、缩短评审发表周期、规避学术不端行为、实现成果快速共享、提高知识转化效率。十余年来，中国科技论文在线始终锐意进取、开拓创新，在内容组织、展现形式、技术应用、制度规范、平台升级等方面进行了大量探索和尝试，为业态发展变革起到了引领、示范作用。
2005年3月：推出刊载证明打印服务，为作者提供论文首发时间证明，及时明确版权归属，有效保护作者权益。
2005年：网站英文版开通，方便海外用户投稿、查询，促进科研成果跨国界传播，从学术角度联通中外，沟通世界。
2005年10月：制定发布了《在线发表科技论文的学术道德和行为规范》，从科技论文的角度明确了科研成果发布行为的道德与规范。
2007年：设立网络时代的科技论文快速共享专项研究课题，引起了情报、出版、科技管理等领域科研人员的广泛关注，掀起了开放获取理论与实践的研究热潮。通过课题的实施，扶助了一批创新人才、培植了一批创新团队、催生了一批创新思想。
2007年：创造性地提出了多维论文的概念，并推出多维论文创作平台，革新论文创作理念，丰富论文表达形式，通过全媒体、立体化阅读，实现科研成果多元化感知。
2007年：获得第一所高校认可，在开放获取平台发表论文可视为正式成果纳入科研绩效评价体系，至今，已有40余家高校承认在中国科技论文在线发表论文可作为职务晋升、研究生毕业的参考依据。
2008年：推出星级证明打印邮寄业务，为论文质量提供官方证明。通过“先发布，后评审”的流程改造，革新论文质量评价模式，与倚重影响因子、期刊排行、论文引用的传统评价模式不同，在线发表更重视网络传播力、影响力，利用浏览、下载、转发、评论等网络使用情况考察论文的价值，这也与近年来国际上盛行的替代性文献计量指标方法相契合。
2008年5月：《中国科技论文在线精品论文》电子期刊创刊，是国内第一个取得正式刊号（CN 11-9150/N5，ISSN1674-2850）的学术类电子期刊，收录中国科技论文在线首发并经过同行评议的优质稿件资源，报道自然科学领域基础和应用研究方面具有重要创新意义的最新成果。
2010年：中国科技论文在线取得互联网出版许可证，成为首批具备互联网出版资质的专业出版网络平台。
2010年5月：推出子网站“open access在线资源集成平台”，整合国内外多个OA仓储资源，方便用户一站式获取免费学术资源。
2011年：网站官方微博开通，随后又分别于同年、2013年、2016年开通iPad版本app、官方微信、手机版本app和微网站，顺应移动互联网发展趋势，积极拓宽宣传推广渠道，满足用户多平台、多端口的学术交流需求。
2011年6月：颁布执行《中国科技论文在线学术监督管理办法》，作为国内首个企业层面的规范文件，明确了对学术不端行为的预防、抑制、惩戒措施。
2015年7月：制定出台《中国科技论文在线电子版权受让协议》，从法律层面明确作者的权利与义务，与前期的《规范》、《办法》一起构筑起科研诚信综合管控体系，为维护良好的科研交流秩序建立了制度保障。
2017年8月：改版后的中国科技论文在线重装出发，发挥品牌优势，构建覆盖多个学科领域、助力不同层次科研人群的知识服务体系。
